Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Pde6cQ91ZQ1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Pde6cQ91ZQ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Pde6cQ91ZQ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Pde6cQ91ZQ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Pde6cQ91ZQ1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pde6cQ91ZQ1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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