Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mark1Q8VHJ5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mark1Q8VHJ5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms