Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Smg8Q8VE18 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg8Q8VE18 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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