Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms