Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD53

Acer2, Alkaline ceramidase 2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer2Q8VD53 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acer2Q8VD53 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acer2Q8VD53 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms