Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubg2Q8VCK3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubg2Q8VCK3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubg2Q8VCK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms