Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh10Q8VCH7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh10Q8VCH7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms