Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef3Q8VCC8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms