Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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