Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rdh16f2Q8K3M1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Rdh16f2Q8K3M1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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