Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nsl1Q8K305 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms