Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncapd2Q8K2Z4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms