Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c1Q8K284 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms