Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh2d5Q8JZW5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms