Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf628Q8CJ78 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf628Q8CJ78 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms