Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep400Q8CHI8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms