Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upp2Q8CGR7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upp2Q8CGR7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms