Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc43a2Q8CGA3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms