Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nedd4lQ8CFI0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms