Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec10Q8CF98 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Colec10Q8CF98 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms