Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF31

Uncharacterized protein C11orf94 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF31 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CF31 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CF31 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CF31 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CF31 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CF31 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CF31 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CF31 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CF31 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CF31 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CF31 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CF31 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms