Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms