Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc17Q8CE13 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc17Q8CE13 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms