Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc87Q8CDL9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms