Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fbxo43Q8CDI2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fbxo43Q8CDI2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms