Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc27Q8CD92 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ttc27Q8CD92 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ttc27Q8CD92 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc27Q8CD92 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms