Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C708 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C708 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C708 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8C708 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8C708 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms