Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubqln3Q8C5U9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms