Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp5Q8BX09 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms