Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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Usp38Q8BW70 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp38Q8BW70 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp38Q8BW70 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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