Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nup54Q8BTS4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms