Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem260Q8BMD6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem260Q8BMD6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms