Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms