Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdca8Q8BHX3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdca8Q8BHX3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms