Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc5a7Q8BGY9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slc5a7Q8BGY9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slc5a7Q8BGY9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slc5a7Q8BGY9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slc5a7Q8BGY9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc5a7Q8BGY9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Slc5a7Q8BGY9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms