Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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