Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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