Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc172Q810N9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc172Q810N9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms