Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChfrQ810L3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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ChfrQ810L3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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ChfrQ810L3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ChfrQ810L3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ChfrQ810L3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ChfrQ810L3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChfrQ810L3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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