Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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