Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp8Q80YR6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms