Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zbed4Q80WQ9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbed4Q80WQ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms