Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup214Q80U93 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup214Q80U93 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms