Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc42bpbQ7TT50 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc42bpbQ7TT50 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms