Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2q1Q7TSS2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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