Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf516Q7TSH3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms