Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdp1Q7TSG2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms