Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms