Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmc8Q7TN58 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmc8Q7TN58 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms