Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Uhrf2Q7TMI3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Uhrf2Q7TMI3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Uhrf2Q7TMI3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Uhrf2Q7TMI3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Uhrf2Q7TMI3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Uhrf2Q7TMI3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Uhrf2Q7TMI3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Uhrf2Q7TMI3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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